Installationen understøtter Inno Setup standard kommandolinjeparametre, og følgende, som er specifikke for PDF-ShellTools opsætningen.

/handlers=

Til at angive, hvilke Windows Shell-udvidelser, der skal registreres. En række af R for at registrere, eller U for at afregistrere, for hver Shell-udvidelse til Windowsversionen, hvor der installeres.
Før Windows Vista er udvidelserne: InfoTip, InfoEdit, Højrekliksmenu, Indsæt/Tilføj/vedhæft ved drop og Kolonnebehandler.
Fra Windows Vista og senere: InfoTip, InfoEdit, Højrekliksmenu, Indsæt/Tilføj/vedhæft ved drop, Egenskabsbehandler og Eftersynsbehandler.
Eksempel: I Windows 8.x, /handlers=RURRRR registrerer alle Shell-udvidelser, undtagen InfoEdit.